Para los usuarios más experimentados y aventureros Manjaro también ofrece la capacidad de configuración y versatilidad para ser moldeado en todos los aspectos, para adaptarse a los gustos y preferencias personales. Manjaro Architect es un instalador en línea de comandos (CLI), disponible junto con el instalador gráfico y un .ISO basado en línea de comandos (CLI) que brinda la opción de instalar cualquier entorno de escritorio de Manjaro, y, ofrece una instalación DE sin entorno de escritorio, opciones de sistema de archivos y capacidad de elegir el gestor de arranque (bootloader) para aquellos que quieren completa libertad para dar forma a su sistema; a partir de una línea de comandos, es completamente libre de elegir sus propios entornos de escritorio, controladores de hardware, aplicaciones de software, etc.